董卓考虑了一下，当天就奏请十一岁的皇上，把司徒杨彪和太尉黄琬给免了官，至于理由是天上星象出现了灾异，说明人间的政治有问题，按规矩要换三公。
董卓改让王允接任司徒，兼录尚书台事务，分管尚书台。这次又是用人错误，王允本也是袁绍引用提拔起来的心腹人。
于是，二月，百官护着汉献帝，向西而行了。洛阳城的数百万人口也开始排着队西去了，步骑兵在后面驱赶，人群互相踩踏，再加上饥饿，还有强盗寇掠，死尸一路从洛阳排到了长安。
一些有钱的百姓，董卓怕他们路上搬运财物疲劳，就出发前给他们捏造罪名，砍了不可胜计的人头，把这些富家的财产全给抄了。
董卓本人则带着军队呆在洛阳。
三月乙巳日，皇帝到了长安了，董卓随即命令长安那边，把刚刚抵达这里的太傅袁隗（袁绍的叔叔），太仆袁基（袁术的哥哥）两家五十余口，都给杀了。讨董联军的盟主袁绍闻讯，知道这是迟早的事情，只好咬牙切齿地痛哭一番。