窦宪回洛阳后，郑众立马率禁军镇守皇宫，同时紧闭城门。窦宪无法与军队取得联系，就算有兵权也无可奈何。郑众率军搜捕城中窦氏一党，将窦宪及其兄弟一一缴械，遣送回封国。之后，汉和帝迫令窦宪自杀。一代名将，一时权臣，最终死于非命。
窦宪死后，章德窦太后遭到软禁，日子也不好过。汉和帝刘肇不是窦太后的亲生儿子，而是汉章帝的梁贵人所生。当年正是因为受窦太后诬陷，梁贵人才忧愤而死。窦太后既是汉和帝的养母，也是他的杀母仇人。窦太后去世后，梁贵人的家人上书诉说冤屈，请汉和帝废黜窦太后尊号，不让她与汉章帝合葬。
汉和帝虽痛恨窦氏，却不忘窦太后养育之恩，亲自下诏说：“论礼，臣子没有贬斥尊上的道理，有恩德便不忍离析，有仁义就不该亏待。”汉和帝仍然将窦太后当作亲生母亲，敬爱有加，让她与汉章帝合葬，魂归敬陵。
在窦氏家族第三次盛极而衰的悲剧中，多少留下一点儿人性的温存。
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窦氏家族并未就此退出东汉历史，而是在外戚与宦官斗争愈演愈烈的时代，又一次卷入权力纷争。
窦宪死后又过了六十多年，到了延熹八年（165年），汉桓帝废邓皇后，在选立新后时本想立其宠爱的田贵人为皇后。以豪强地主为主的士大夫纷纷抗议，认为田贵人出身卑微，不宜为后。太尉陈蕃进言，“窦族良家”，建议汉桓帝立贵人窦妙为皇后。文人那支笔比亲娘还厉害，汉桓帝迫于舆论压力，也无法按个人意愿选择皇后，只好放弃爱情，以“娶先大族”的原则册立窦妙为皇后，但从此很少宠幸窦皇后。