死去元知万事空，但仇鸾的故事并没有因为他的死就结束了。他生前倚仗皇帝的信赖，得罪了许多大臣，自己的操守也有问题。徐阶就上奏皇帝揭发仇鸾的罪行，朱厚熜大惊，命令心腹锦衣卫陆炳暗中调查。陆大人以前查到过仇鸾的罪行，但证据不足，未敢上报；时义、侯荣担心之前通敌的事情败露，为自己带来杀身之祸，就准备投奔蒙古，在居庸关被抓获。审讯之后，他们把仇鸾之前的罪行一五一十地交代出来。嘉靖皇帝接到报告，气得火冒三丈，这个无能的大骗子，蒙蔽了朕那么久，实在是可恨。虽然已经死了，但还是不可以放过，他又派人把仇鸾的棺材劈开，砍下头颅，传首九边，让大家都看看，这位奸恶之徒是怎样的下场。时义、侯荣被斩首，仇鸾父母、正妻、儿子被斩首，小妾、女儿、孙子给功臣之家做奴仆，没收所有非法所得。兵部尚书赵锦被弹劾是仇鸾的党羽，朱厚熜将其罢免，发配边境充军。
一位皇帝的宠臣垮台了，严嵩感觉压力小了许多，朱厚熜对待自己更热情了，杨继盛也可以从苦寒之地归来。可是，边疆的战火不会因仇鸾的死去而停止，蒙古人继续不断入侵，明军则疲于应对。嘉靖四十二年（公元1563年），鞑靼骑兵从墙子岭突破边防，在三河、顺义大肆劫掠，几乎就是庚戌之变的翻版。明朝军队一如既往，尾随着，不敢打，像个观众似的，等蒙古人杀完、抢完，又注视他们离去。五十七岁的朱厚熜心如死灰，看见了火光，知道敌人不远，可将军们就是不去截杀。这些贪生怕死，又没有本事的官兵让朱厚熜彻底失去了信心。长时期的战争，给两族人民带来深重灾难，也使朱厚熜变得毫无脾气。三年后，他“羽化成仙”了，愿天堂没有金戈铁马。