《国朝献征录》120卷。是书凭借焦竑应聘修本朝史时所搜集的资料，并在其后继续努力下，编辑而成。此书博采自洪武以迄嘉靖时期的名人事迹，按宗室、戚畹、勋爵、内阁、六卿以下各官，分类标目，依次编排。没有任过官职的，按孝子、义人、儒林、艺苑等目，分类汇编。大多数人物传记，都注明引述之书，内容丰富，查用方便，保存了明中期以前的人物传记资料，可用来校正实录和《明史》。
《玉堂丛语》8卷，是一部笔记体史料集。是书仿《世说新语》体例，记万历以前翰林人物言行，分行谊、文学、言语、政事、铨选、筹策等54门，书首有焦竑万历四十六年（1618年）所撰小序《书玉堂丛语》，以及顾起元、郭一鹗的序。顾序概括了此书的性质、内容和特点。顾序称：“《玉堂丛语》若干卷……仿临川《世说》而记之者也。其官则自阁部元僚，而下逮于待诏应奉之冗徒。其人则自鼎甲馆选，而旁及于征辟荐举之遗贤。其事则自德徒、政事、文学、言语，而征摭于谐谑、排觝之卮言。其书则自金匮石室、典册高文，而博采于稗官野史之余论。义例精而权量审，闻见博而取舍严。词林一代得失之林，煌煌乎可考镜矣！”郭序称其“宛然成馆阁诸君子一小史然”。此书征引广博，皆注出处，多有未见之书，明代稗乘史资，赖以流传。书中所记如叶淇盐法纳粟实边开中的制度、周忱在户部尚书任内为了备荒设立济农仓积米囤谷的方法、外戚勋贵庄田增租加税五分的害民、杨士奇之纵子横暴乡里，以及其他官僚地主之骄奢生活，皆有助于研究明代史事。[24]