脱该汗还未等康里兵团士兵全部进城，就下令关闭城门，他暗下决心，决不再出战了。
穆斯林长老们又来了，劝他投降。他们的理由和大多数花剌子模城中穆斯林长老们的理由一样，保全生命，保全寺院，保全伊斯兰之光。
脱该汗知道自己已尽力，而且再也没有力量抵抗成吉思汗的虎狼之师。可他默不作声，直到穆斯林长老们走时，他才缓缓地说：“投降这种事，我堂堂一个汗，怎么可以打头阵呢？”
穆斯林长老们大欢喜起来，第二天就开城门，跑到成吉思汗营帐，向成吉思汗表达了顺服之心，并请求成吉思汗宽恕全城人的性命。成吉思汗笑了笑，说：“你们能做主吗，城里还有抵抗力量啊！”
穆斯林长老又三步并作两步跑回城，轻易地说服了脱该汗，脱该汗带着大批军官走进成吉思汗的帐篷，向成吉思汗磕头认错，请求成吉思汗饶恕守军的性命，成吉思汗故作宽和地笑着答应了。
极少一部分守军不相信成吉思汗的仁慈，于是退到内城，准备殉国。
撒马尔罕被围的第六天早上，西城门大开，成吉思汗兵团耀武扬威地进了城，傲慢地欣赏放下武器、在路边欢迎他们的康里兵团。
成吉思汗的第一步，命令俘虏们拆除撒马尔罕外的城墙。第二步，把撒马尔罕的平民和投降的康里兵团驱赶到城外，蒙古人开始在城内大肆洗劫。第三步，询问二十头战象的饮食结构。有人告诉他，这些东西吃草，成吉思汗说，那就放了它们，结果二十头战象陆续饿死。第四步，和脱该汗谈心。